MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 6056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015183	AAC	2	6	520033	520038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_015183	TA	4	8	520042	520049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015183	ATT	2	6	520078	520083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015183	GAT	2	6	520094	520099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015183	ATTC	2	8	520852	520859	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_015183	GGC	2	6	524855	524860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_015183	GGC	2	6	526139	526144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_015183	CGC	2	6	526149	526154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_015183	GCCCG	2	10	526447	526456	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1010	NC_015183	GCG	2	6	526558	526563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_015183	GTT	2	6	529888	529893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_015183	AG	3	6	529910	529915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_015183	TTGA	2	8	529935	529942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015183	GCC	2	6	529963	529968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_015183	GAG	2	6	530570	530575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015183	CGG	2	6	531487	531492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_015183	GGC	2	6	531632	531637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_015183	TTTG	2	8	532367	532374	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015183	GCC	2	6	532409	532414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_015183	GCGG	2	8	532419	532426	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_015183	TTGC	2	8	534241	534248	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_015183	CAG	2	6	534288	534293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_015183	TCC	2	6	536249	536254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_015183	GC	4	8	536257	536264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_015183	CCTCT	2	10	536282	536291	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1026	NC_015183	T	6	6	536311	536316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015183	GCC	2	6	536353	536358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_015183	TAAG	2	8	536363	536370	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015183	CAATGA	2	12	536429	536440	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1030	NC_015183	CGG	2	6	537895	537900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_015183	GCC	2	6	537905	537910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_015183	AACGG	2	10	537922	537931	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1033	NC_015183	GCGCG	2	10	537952	537961	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1034	NC_015183	AGGG	2	8	537972	537979	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015183	AAC	2	6	541864	541869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_015183	T	6	6	543020	543025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015183	CAT	2	6	544966	544971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_015183	GGCT	2	8	544995	545002	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_015183	ATC	2	6	545023	545028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_015183	GAGGC	2	10	545115	545124	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1041	NC_015183	GTC	2	6	547048	547053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_015183	TAATC	2	10	549316	549325	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1043	NC_015183	CAT	2	6	552558	552563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_015183	AAC	2	6	552650	552655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_015183	ATG	2	6	553928	553933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015183	ATG	2	6	554322	554327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015183	T	6	6	554335	554340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015183	CT	3	6	555527	555532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_015183	TTGG	2	8	555536	555543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015183	AAGGG	2	10	555578	555587	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015183	TC	4	8	556893	556900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_015183	TG	3	6	556940	556945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015183	TACATT	2	12	556965	556976	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1054	NC_015183	AACA	2	8	556997	557004	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_015183	GT	4	8	557038	557045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_015183	T	6	6	558574	558579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015183	TGCTG	2	10	558606	558615	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1058	NC_015183	CG	3	6	559815	559820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_015183	CGGC	2	8	559833	559840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_015183	AGGGT	2	10	559976	559985	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015183	TCG	2	6	562986	562991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_015183	TC	3	6	563119	563124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_015183	A	6	6	563128	563133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015183	GGC	2	6	563148	563153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_015183	GCC	2	6	563160	563165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_015183	GCC	2	6	563175	563180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_015183	CTG	2	6	564865	564870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_015183	CGG	2	6	564905	564910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_015183	CAC	2	6	568764	568769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_015183	GCG	2	6	568799	568804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_015183	CCG	2	6	568812	568817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_015183	TGAA	2	8	568820	568827	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015183	T	6	6	568959	568964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015183	C	6	6	569015	569020	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1075	NC_015183	C	6	6	569107	569112	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1076	NC_015183	CGT	2	6	574319	574324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_015183	CTG	2	6	574359	574364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_015183	GCA	2	6	574369	574374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_015183	T	6	6	574404	574409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_015183	TCCT	2	8	574415	574422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_015183	CAA	2	6	576059	576064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_015183	GGA	2	6	576125	576130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_015183	TGC	2	6	576606	576611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_015183	GCG	3	9	577747	577755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_015183	GCC	2	6	577771	577776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_015183	AG	3	6	577837	577842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1088	NC_015183	TGT	2	6	579332	579337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_015183	T	6	6	582146	582151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015183	GCG	2	6	582220	582225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_015183	CCG	2	6	582241	582246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_015183	A	7	7	583368	583374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015183	TCC	2	6	584442	584447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_015183	ATAC	2	8	584477	584484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_015183	TGC	2	6	584505	584510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_015183	GAG	2	6	584511	584516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_015183	AAGT	2	8	585668	585675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_015183	CTTA	2	8	585681	585688	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_015183	CGC	2	6	585698	585703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_015183	GCG	2	6	586713	586718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_015183	GAG	2	6	586731	586736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015183	TCC	2	6	587321	587326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_015183	CT	3	6	587349	587354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_015183	GAC	2	6	587372	587377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_015183	GGA	2	6	588668	588673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015183	CGG	2	6	590628	590633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_015183	TGA	2	6	590650	590655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1109	NC_015183	GAT	2	6	592995	593000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_015183	GGCAG	2	10	593047	593056	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1111	NC_015183	G	6	6	593058	593063	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015183	A	6	6	593599	593604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015183	TCC	2	6	593615	593620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_015183	CG	3	6	595517	595522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_015183	TGC	2	6	595606	595611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_015183	A	6	6	595638	595643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015183	AATA	2	8	595648	595655	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_015183	AAT	2	6	595692	595697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015183	TAT	2	6	595710	595715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015183	ATT	2	6	595762	595767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015183	TCA	2	6	595777	595782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_015183	CGC	2	6	595787	595792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_015183	G	6	6	597801	597806	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015183	TGA	2	6	600335	600340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_015183	T	7	7	600351	600357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_015183	CCAG	2	8	601740	601747	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_015183	AAG	2	6	601766	601771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_015183	CGC	2	6	601778	601783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_015183	CG	3	6	601789	601794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_015183	CGC	2	6	601839	601844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_015183	AATGG	2	10	601860	601869	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015183	CGC	2	6	602761	602766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_015183	T	6	6	602783	602788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_015183	CGATTC	2	12	602813	602824	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_015183	CCG	2	6	602827	602832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1136	NC_015183	GTT	2	6	603807	603812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_015183	A	6	6	603827	603832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1272	NC_015183	A	7	7	670304	670310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1273	NC_015183	AT	3	6	670334	670339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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